«Палеогенетический анализ патогенных микроорганизмов в археологических останках человека, представляющих Центрально-Евразийский регион». Научный руководитель: к.б.н., профессор Джансугурова Л.Б.

По приоритету: «Научные исследования в области естественных наук».

Название проекта: «Палеогенетический анализ патогенных микроорганизмов в археологических останках человека, представляющих Центрально-Евразийский регион» (АР08856654).

Сроки реализации: 01.10.2020 г. – 31.12.2022 г. (27 месяцев).

Цель проекта: Изучение геномов возбудителей заболеваний в древних останках человека из некрополей Центрально-Евразийского региона.

Задачи:

  • Систематизация и подготовка археологического материала. Выделение палео-ДНК из древних человеческих останков (не менее 100 индивидов);
  • Подготовка ДНК-библиотек и проведение высокопроизводительного секвенирования (NGS) на платформе Illumina. Первичная обработка данных, оценка контаминации палео-ДНК.
  • Биоинформационный скрининг данных NGS на известные возбудители заболеваний человека, включая возбудителей чумы, туберкулеза, воспалительных и желудочно-кишечных заболеваний.
  • Секвенирование выявленных патогенов в исследуемых древних образцах для верификации скрининга и анализа их геномов. Филогенетический анализ.
  • Сравнительный анализ геномов с использованием мировых баз данных по древним/современным геномам микроорганизмов и человеческих популяций в контексте эпидемиологии и истории человеческих миграций.