Лаборатория популяционной генетики

ОСНОВНЫЕ ПУБЛИКАЦИЙ:

Джансугурова Л.Б.

Палеогенетический анализ знаковых феноменов, представляющих раннюю историю великой степи // Материалы Международной научно-практической конференции «История и культура Великой степи». Под ред. М. Х. Абусеитовой. Составители: Н. Ж. Шаймарданова, З. С. Табынбаева. – Алматы: «Шығыс пен Батыс», 2020. — С. 36-46

Gnecchi-Ruscone G.A., Khussainova E., Kahbatkyzy N., Musralina L., Djansugurova L., Krause J.

Ancient genomes from the Kazakh steppe unravel the history of the scythians // Материалы Международной научно-практической конференции «История и культура Великой степи». Под ред. М. Х. Абусеитовой. Составители: Н. Ж. Шаймарданова, З. С. Табынбаева. – Алматы: «Шығыс пен Батыс», 2020. — Р. 46-50.

Tukhanova, N., Shin, A., Abdiyeva, K., Turebekov, N., Yeraliyeva, L., Yegemberdiyeva, ….Musralina, L., et al.

Serological investigation of orthohantaviruses in patients with fever of unknown origin in Kazakhstan. (2020) Zoonoses and Public Health, 67 (3), pp. 271-279. DOI: 10.1111/zph.12683 (Q1, TR- Impact Factor: 2.702 (2020); SJR — H index 65; CiteScore 2020 — 4.4; процентиль – 70%)

Turebekov, N., Abdiyeva, K., Yegemberdiyeva, R., ….. A., Musralina, et al.

Occurrence of Anti-Rickettsia spp. Antibodies in Hospitalized Patients with Undifferentiated Febrile Illness in the Southern Region of Kazakhstan (2021) American Journal of Tropical Medicine and Hygiene, 104 (6), pp. 2000-2008. DOI: 10.4269/ajtmh.20-0388 (Q4, TR- Impact Factor: 2.345 (2021); SJR-1.015; H index 151; процентиль – 60%)

Kocher A., Papac L, Barquera R., Key F.M., Spyrou M.A., Hübler R., Prüfer K., Rohrlach A.B., Aron F., Stah R., Wissgott A., Mittnik A., Villalba-Mouco V., Neumann G.U., Rivollat M., van de Loosdrecht M.S., Majander K., Tukhbatova R.I., Musralina L., Ghalichi A., Penske S., Sabin S., Miche M., Gretzinger J., Nelson E.A., Ferraz T., Nägele K., Parker C., Keller M., Guevara E.K., Feldman M., Eisenmann S., Skourtanioti E., Giffin K., Gnecchi Ruscone G.A., Friederich S., Schimmenti V., Tejedor-Rodríguez C., García-Martínez de Lagrán Í., Arcusa-Magallón H., Garrido-Pena R., Royo-Guillén J.I.,  Khartanovich V., Karapetian M.K., Chaplygin M.S., Kufterin V.V., Khohlov A.A., Chizhevsky A.A., Stashenkov D.A., Kochkina A.F., Rottier S., Kacki S., Saintot S., Kaverzneva E., Belinskiy A.B., Velemínský P., Limburský P.,  Kostka M., Chinique de Armas Y., Hernandez Godoy S.T., Hernández-Zaragoza D.I., Binder D., Lefranc Ph., Kantorovich A.R., Maslov V.E., Lai L., Zoledziewska M., Beckett J.F., Langová M., Danielisová A., Sperduti A., Beckett S., Salter S.J., von Heyking K., Burger R.L., Salazar L.C., Amkreutz L., Navruzbekov M., Rosenstock E., Alonso-Fernández C., Slavchev V., Kalmykov A.A., Atabiev B.Ch., Batieva E., Calmet M.A., Llamas B., Schultz M., Krauß R., Jiménez-Echevarría J., Francken M., Shnaider S., Altena E., Van de Vijver K., Fehren-Schmitz L., Tung T.A., Lösch S., Dobrovolskaya M., Makarov N., Read C., Van Twest M., Sagona C., Ramsl P.C., Akar M., Yener K.A., Ballestero E.C., Cucca F., Mazzarello V., Utrilla P., Rademaker K., Fernández-Domínguez E., Baird D., Semal P., Márquez-Morfín L., Roksandic M., Steiner H., Salazar-García D.C., Shishlina N., Erdal Y.S., Hallgren F., Boyadzhiev Y., Boyadzhiev K., Küßner M., Sayer D., Onkamo P., Skeates R., Buzhilova A., Khussainova E., Djansugurova L.B., Beisenov A.Z., Samashev Z., Massy K., Rojo-Guerra M., Mannino M., Moiseyev V., Mannermaa K., Balanovsky O., Deguilloux M.-F., Reinhold S., Hansen S., Kitov E.P., Dobeš M., Ernée M., Meller H., Warinner C., Schiffels S., Stockhammer Ph.W., Bos K., Posth C., Herbig A., Haak W., Krause J., and Kühnert D.

Ten millennia of hepatitis B virus evolution // Science. – 2021. — Vol. 374, Is. 6564. – P. 182-188. doi: 10.1126/science.abi5658. Epub 2021 Oct 7. IF=41.846 (2020) SJR – H-index 1186 Q1 – принято к печати 13 июля 2021, публикация 07 октября 2021 г.

Elmira Khussainova, Ilya Kisselev, Olzhas Iksan, Bakhytzhan Bekmanov, Liliya Skvortsova, Alexander Garshin, Elena Kuzovleva, Zhassulan Zhaniyazov, Gulnur Zhunussova, Lyazzat Musralina, Nurzhibek Kahbatkyzy, Almira Amirgaliyeva, Mamura Begmanova, Akerke Seisenbayeva, Kira Bespalova, Anastasia Perfilyeva, Gulnar Abylkassymova, Aldiyar Farkhatuly, Sara V. Good and Leyla Djansugurova.

Genetic Relationship Among the Kazakh People Based on Y-STR Markers Reveals Evidence of Genetic Variation Among Tribes and Zhuz // Frontiers in Genetics (IF4.599),  Pub Date : 2022-01-07, DOI: 10.3389/fgene.2021.801295

Iksan O., Kisselev I., Garshin A., Kuzovleva E., Skvortsova L. et al.

Analysis of the Kazakh clan Baiuly based on the distribution of the Y-chromosome haplogroups // International Journal of Biology and Chemistry 13, No 2, 80 (2020). P. 80-87.

Джансугурова Л.Б., Мусралина Л.З., Хусаинова Э.М., Бекманов Б.О., Самашев З.С. Некки-Русконе Г.А., Краузе Й.

Палеогенетический анализ костных останков людей, представляющих Хунно-Сяньбийский пласт Береля Казахстанской части Алтая // Мир большого Алтая. Международный научный журнал. 2020. – № 6 (2). – С. 949-958.

Spyrou M. A., Musralina L., Guido A. Gnecchi-Ruscone, Kocher A., Kuhnert D., Kirsten I. Bos, Djansugurova L., et al.

Towards an understanding of the early history of the Second Plague Pandemic // ISBA 2021 — 9th International Symposium on Biomolecular Archaeology. 1-4 June 2021

Gnecchi-Ruscone Guido Alberto,  Krause J.,  ……. Djansugurova L.  Khussainova E., Nurzhibek K., Musralina L. et al. 

Origin and spread of the Iron Age eastern Scythians revealed through a one-thousand-year transect of ancient genomes across the Central Asian steppe // ISBA 2021 — 9th International Symposium on Biomolecular Archaeology. 1-4 June 2021.

G. A. Gnecchi-Ruscone, E. Khussainova, N. Kahbatkyzy, L. Musralina, M. A. Spyrou, R. A. Bianco, R. Radzeviciute, N. F. G. Martins, C. Freund, O. Iksan, A. Garshin, Z. Zhaniyazov, B. Bekmanov, E. Kitov, Z. Samashev, A. Beisenov, N. Berezina, Y. Berezin, A. Z. Bíró, S. Évinger, A. Bissembaev, G. Akhatov, A. Mamedov, A. Onggaruly, D. Voyakin, A. Chotbayev, Y. Kariyev, A. Buzhilova, L. Djansugurova, C.Jeong, J. Krause.

Ancient genomic time transect from the Central Asian Steppe unravels the history of the Scythians // Science Advances. 7, eabe4414. 2021 (Q1, процентиль — 97%).

Iksan, O., Kisselev, I., Garshin, A., Skvortsova, L., Zhaniyazov, Z., Alpysbes, M., Chiang, C., Musralina, L., Zhunussova, G., & Khussainova, E.

Analysis of the Kazakh tribe Baiuly based on the distribution of the Y-chromosome haplogroups // International Journal of Biology and Chemistry. Vol.13(2), P.80-87. doi:10.26577/ijbch.2020.v13.i2.10.

Ruslan Mussabayev, Ainash Childebayeva, Zhassulan Zhaniyazov, Olzhas Iksan.

Preliminary data of a genome-wide analysis of SNP data in 96 men of kazakh ethnicity // Материалы международной научной конференции студентов и молодых ученых «ФАРАБИ ƏЛЕМІ» Алматы, Казахстан, 6-9 апреля 2020 года. — C.259.

Jeong, O. Balanovsky, E. Lukianova, N. Kahbatkyzy, P. Flegontov, V. Zaporozhchenko, A. Immel, Ch.-Ch. Wang, O. Ixan, E. Khussainova, B. Bekmanov, V. Zaibert, M. Lavryashina, E. Pocheshkhova, Y. Yusupov, A. Agdzhoyan, S. Koshel, A. Bukin, P. Nymadawa, Sh. Turdikulova, D. Dalimova, M. Churnosov, R. Skhalyakho, D. Daragan, Y. Bogunov, A. Bogunova, A. Shtrunov, N. Dubova, M. Zhabagin, L. Yepiskoposyan, V. Churakov, N. Pislegin, L. Damba, L. Saroyants, Kh. Dibirova, L. Atramentova, O. Utevska, E. Idrisov, E. Kamenshchikova, I. Evseeva, M. Metspalu, A.K. Outram, M. Robbeets, L. Djansugurova, E. Balanovska, S. Schiffels, W. Haak, D. Reich and J. Krause.

Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia // Nature Ecology & Evolution.  2019. — Vol.3. – P. 966-976. https://doi.org/10.1038/s41559-019-0878-2 (Q1, процентиль – 98%).

Djansugurova L.B., Nurzhibek, S.K. Nurgazieva, Z.S. Samashev, B.O. Bekmanov.

The analysis of paternal and maternal lines of ancient objects from Eleke Sazy necropolis // Электронный журнал «edu.e-history.kz» № 3. http://edu.e-history.kz/ru/publications/view/1248.

Khabatkyzy N, Guido A.G.R., Zaibert V.F., Samashev Z., Kirov E., Ixan O., Brandt G., Khussainova E., Bekmanov B, Djansugurova L., Krause J., Jeong Ch.

Archaeogenetic study of ancient human remains within the territory of Kazakhstan // Международная научная конференция, посвященная памяти академиков В.П.Алексеева и Т.И. Алексеевой. Тезисы конференции VIII Алексеевские чтения. Москва 26-28 августа 2019

Nurzhibek K., Raffaela Bianco,Choongwon Jeong, Immel A., Chuan-chao Wang, Ixan O.A., Évinger S., Zaibert V.F., Khussainova E.M., BekmanovB.O., Djansugrova L.B.,  Krause J.

Paleogenetic study of ancient archaeological finds related to Kazakh ethnogenesis // 8th International Symposium on Biomolecular Archaeology. 18-21 September, 2018. Jena, Germany. Programme. Abstract book. P.148.

ПРЕДОСТАВЛЕНИЕ УСЛУГ:

• Анализ ДНК отцовской линии (анализ ДНК по 17 микросателлитным локусам Y-хромосомы) на основе секвенирования
• Анализ ДНК материнской линии (анализ гипервариабельной области d-петли митохондриальной ДНК (мтДНК) человека на основе секвенирования нового поколения Miseq
• Анализ ДНК материнской линии (анализ полного генома митохондриальной ДНК) человека на основе секвенирования нового поколения Miseq
• Анализ происхождения по y-хромосоме на микрочиповом генотипировании (iScan, Illumina)
• Анализ аутосомных 16 STR-локусов

КОЛЛЕКТИВ ЛАБОРАТОРИИ:

Хусаинова Эльмира Минагуловна	Ведущий научный сотрудник
Чильдебаева Айнаш Еркеновна	Старший научный сотрудник
Мусралина Ляззат Зенураиновна	Научный сотрудник
Иксан Олжас Абаевич	Научный сотрудник
Жаниязов Жасулан Ануарбекович	Научный сотрудник
Кағыбаткызы Нұржібек	Научный сотрудник

Стажировки сотрудников: Сотрудники лаборатории прошли научно-практические стажировки и интенсивный кратковременный курс по палеогенетике в Лаборатории палео-ДНК университета Лейкхед (Тандер-Бей, Онтарио, Канада) и в Институте археологических наук Тюбингенского Университета (Тюбинген, Германия). Сотрудники лаборатории активно внедряют в научную практику приобретенные навыки и используют в исследованиях методы ПЦР, ПДРФ, секвенирования ДНК, NGS анализа и работы с палео-ДНК.

Сотрудничество лаборатории: Лаборатория сотрудничает с несколькими научными учреждениями разного профиля: Институт археологии имени А.Х. Маргулана (Алматы, Казахстан), Венгерский музей естественной истории (Будапешт, Венгрия), Институт археологических наук Тюбингенского Университета (Тюбинген, Германия), Институт Макса планка (Йена, Германия), научно-реставрационная лаборатория ТОО «Остров Крым» (Алматы, Казахстан).

Биобанк и археологическая коллекция лаборатории: Сотрудниками лаборатории проведен рад экспедиций по территории Казахстана и собраны биологические образцы от 1546 человек казахской национальности различной родовой принадлежности.

В лаборатории популяционной генетики хранятся фрагменты костных останков и зубов важных археологических находок: «Урджарская принцесса»(IV-III вв. до н.э.), скелет гуннского периода (V в н.э.), находки энеолитического периода с поселения Ботай (IV-III вв. до н.э.), несколько образцов костных останков с некрополя «Хан Моласы».